1×01 – Die Wunden des Krieges
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Im Jahr 2372 wird die Technikerin Lina Gilbert, Agentin der Sternenflotte, in das Orionsyndikat eingeschleust, eine berüchtigte Gruppe von Weltraumpiraten, die in der Orion-Region operiert. Durch die Informationen, die Lina in der Zelle von Thadial Boka sammelt und an ihre Mittelsmänner weiterreicht, kann die Sternenflotte das Syndikat unter Kontrolle halten.
Ein Jahr später zieht die Sternenflotte ihre Präsenz aus dem Orion-Sektor ab. Der Krieg gegen das Dominion ist ausgebrochen und alle Resourcen werden an der Front bei Deep Space Nine benötigt. Der Rigelianer Jelev Haras tritt der Zelle des Syndikats bei, ein ehemaliger Sternenflotten-Offizier, der desertierte, als die Föderation eine 600 Schiffe große Flotte in einen aussichtslosen Kampf schickte.
Während im Beta-Quadranten der Krieg tobt, kann das Orion-Syndikat seinen Einfluss entscheidend ausdehnen. Während es immer mehr Mitglieder gewinnt, geht die Kontrolle durch die Sternenflotte immer weiter zurück. Schließlich reißt Linas Kontakt ganz ab. Während dieser Zeit verliebt sie sich in Jelev, sie verloben sich schließlich. Weitere Mitglieder stoßen zur Gruppe dazu: Kelvin Jacob, ein Waffennarr, der einst unehrenhaft aus der Sternenflotte entlassen wurde, der Frauenheld Brent Gibbs von Naraya sowie die junge Orionerin Maras, die dem Sklaventum entflohen ist und das orionische System stürzen will.
Das Jahr 2376: der Krieg ist vorbei und das Orion-Syndikat zu einer mächtigen Institution geworden. Boka hat Informationen über ein Tellariten-Schiff, das ein neues Waffensystem zu den großen Werften der Sternenflotte transportieren soll und sie machen sich mit dem neuen Schiff „Black Eagle“ auf Abfangkurs. Doch sie finden das Tellariten-Schiff zerstört vor, das Waffensystem ist nicht mehr an Bord, die Sensordaten zeigen den Angriff eines Schiffs unbekannter Bauart. Die Black Eagle folgt der Ionenspur zu einer verlassenen Föderationskolonie, wo mehrere Schiffe gelandet sind. Boka und Lina begeben sich auf die Oberfläche und geraten in eine Versammlung der „New Order“, einem Zusammenschluss mehrerer unabhängiger Welten, die die Gunst der Stunde nutzen und eine neue Macht im Alpha-Quadranten bilden wollen, darunter auch Coridan, der Erzfeind von Orion. Boka findet heraus, dass die Macht des Syndikats das einzige ist, was viele Welten noch daran hindert, sich der „New Order“ anzuschließen, was den Untergang Orions bedeuten würde. Lina realisiert, dass auch die Föderation sich das nicht leisten kann. Bevor sie nach Orion zurückkehren, hinterlässt Lina in der Kolonie eine automatische Nachricht für die Sternenflotte. Dabei wird sie von den Wachen entdeckt und verfolgt. Die Black Eagle liefert sich ein Gefecht mit zwei der anwesenden Schiffe und kann dann leicht beschädigt entkommen.